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因枉罪而遭囚禁的鳴人，被送入了無法逃離的監獄·鬼燈城。被城主·無為剝奪了忍者力量的鳴人，也同時被神秘的囚徒們接近。草忍者村的暗部·龍舌，另有陰謀的雲之忍者·麻呂伊…在最後，他們的目標究竟是？ 主張伸冤的鳴人因不斷嘗試逃獄，其性命也遭不少人狙擊！ 鬼燈——在花語中的含意為【虛偽】。 在邪氣之城內隱藏的悲慘事實被揭開之時，賭上聲譽的忍者也將展開他們最後的決戰……...

怪盜基德再度發出預告信，目標是俄羅斯羅曼諾夫王朝的皇室祕寶「記憶彩蛋」。柯南與服部聯合保護「記憶彩蛋」，因毛利小五郎將作案時間推理錯誤使基德得逞，但基德於逃走中途被不明人物狙擊。自此引出一連串疑問，柯南將解開一連串事件。...